微波化学反应器是一种高频率的电磁波，其本身并不产生热。自然界的微波因为分散不集中，故不能作为一种能源，而利用的磁控管则可将电能转变为微波，以每秒2450MHz的振荡频率穿透介质，当介质有合适的介电常数和介质耗损时，便会在交变得电磁场中发生高频振荡，使能量在介质内部积蓄起来。对化学反应而言，可同时产生热效应和非热效应微波化学反应器操作步骤：
1．把微波化学反应器电源接通，打开电源开关。电源指示灯、炉灯、液晶屏同时亮起。
2．微波腔体内必须放置好您所需要反应的化学物质。
3．设定工作时段的参数
反应器共分五个工作时段。每个工段下档位，温度，时间独立可调。
档位输入范围01-10，01为低档，表示10％功率。10为，表示为100％功率。
温度输入范围0-250，表示0℃250℃。
时间输入范围0-999，表示0秒999秒。
4．运行微波化学反应器
按动触摸面板确认键，确认设定的工作时段参数为有效数据。此时液晶屏光标将会消失，不再接受新的输入数据。本次确认的参数将保存在Flash存储器，断电后不会丢失，按动触摸面板开启键，微波化学反应器按照用户设定开始工作，微波开始发射。液晶屏右下角显示微波输出中。液晶屏实时显示当前的实际温度，有效功率，实际时间按动触摸面板关闭键，微波化学反应器停止工作，微波不再发射。液晶屏右下角显示微波 已停止微波化学反应器运行中修改反应条件：按动触摸面板设定键，液晶屏光标再次出现，可以修改参数，修改完毕后，必须按动触摸面板确认键进行确认。不必再次按开启键。
5．磁力搅拌器的控制
磁力搅拌器的控制为单独控制不受微电脑控制，顺时针旋动微波化学反应器门右侧的旋钮，磁力搅拌器的速度随之提高，反之下降。
